Adapun cara penilaian untuk menentukan sekolah terbaik skala nasional LTMPT menggunakan metode sebagai berikut:
1. Nilai UTBK dihitung berdasarkan hasil 60% nilai Tes Potensi Skolastik (TPS) ditambah 40 persen nilai Tes Kemampuan Akademik (TKA)
- Nilai TPS berdasarkan rerata TPS tiap peserta dari sekolah tersebut
- Nilai TKA berdasarkan rerata TKA (Saintek dan Soshum) tiap peserta dari sekolah tersebut
- Peserta yang mengikuti ujian Campuran, nilai TKAnya diambil yang tertinggi
1. Sekolah diurutkan berdasarkan nilai total tertinggi hingga terendah
2. Diambil 1.000 sekolah dengan Nilai Total Tertinggi